農村合作醫療網上交費方式如下：

1、支付寶交費，在市民中心，找到所在的城市，在詳情頁選擇社保，如有開通社保繳費的，根據頁面提示進行操作。

2、微信繳費，搜索城市服務，定位到所在城市，在常用服務中會提供社保繳費的小程序，點擊打開根據頁面提示操作即可。

3、還可以通過當地官網公布的人社APP，或者登陸當地人社官網掃碼下載，注冊登陸后，選擇農村合作醫療也就是城鄉居民醫保繳費，根據提示操作繳費即可。