醫保甲類藥品和乙類藥品的區別為：

1.兩者的標識顏色不同，甲類藥品OTC是紅色，乙類藥品OTC是綠色；

2.兩者的銷售途徑不一樣，甲類藥品只可以在藥店里面進行銷售，而乙類藥品不僅可以在藥店里面進行銷售，而且還能在經過了藥監部門批準之后的賓館或者商店等地進行銷售；

3.兩者的報銷比例不同，甲類藥品一般可以報銷100%，而乙類藥品只能報銷一部分，也就是說，若參保人購買的是乙類藥品，那么還需要自己自付一部分的錢，具體的報銷比例會根據當地的政策來定。